Klastry jsou regionální odvětvová seskupení společností a podniků, jejichž cílem je zvýšení konkurenční schopnosti sdružených členů, posílení inovací, podpora exportu a dosažení ekonomického růstu podniků v dané oblasti, jejich dodavatelů, poskytovatelů specializovaných služeb, vzdělávacích a výzkumných institucí.
Jsou zakládány za pomocí prostředků Evropské unie.
Odborná pracoviště univerzity spolupracují například v těchto klastrech:
OMNIPACK, klastr výrobců obalů, sdružení se sídlem v Jaroměři
- účast prostřednictvím činností Fakulty ekonomicko-správní
NANOMEDIC, medicínsko-farmaceutický klastr, Dolní Dobrouč
- účast prostřednictvím činností Fakulty chemicko-technologické
